夏場の脱水が主な原因と述べましたが、他にも以下の様な原因があります。 「尿が濃くなる」「結石の材料が増える」「結石を防ぐ成分が減る」のいずれかを示す原因です。
| 原因 | なぜ結石ができやすくなるか |
| 水分摂取不足 | 尿量が減り、カルシウムやシュウ酸などの結石成分が濃縮される。 |
| 肥満 | 尿中のカルシウム、尿酸、シュウ酸が増加し、結石形成リスクが上昇する。 |
| メタボリック症候群 | 尿が酸性化しやすく、尿酸結石やカルシウム結石ができやすくなる。 |
| 高塩分食 | ナトリウム排泄増加に伴い尿中カルシウム排泄も増え、カルシウム結石の原因となる。 |
| 高動物性蛋白食 | 尿中カルシウム・尿酸が増加し、クエン酸（結石抑制物質）が減少する。 |
| 高シュウ酸食 | 尿中シュウ酸が増え、カルシウムと結合してシュウ酸カルシウム結石を形成する。 |
| 遺伝的要因 | シスチン尿症や原発性高シュウ酸尿症など、結石を作りやすい体質がある。 |
| 尿路感染 | 細菌が尿をアルカリ化し、リン酸マグネシウムアンモニウム（感染結石）が形成される。 |
| 代謝異常 | 高カルシウム尿症、高尿酸尿症、低クエン酸尿症などにより結石成分が増加する。 |